手术室净化工程就其控制对象来说，共分两种，一种为工业洁净室，另一种为生物洁净室。工业洁净室室以控制非生物微粒的污染为主要任务，而生物洁净室，则以控制生物微粒的污染为主要任务。但是，非生物微粒还是生物微粒，在空气净化技术领域都被看做微粒，都具有微粒的属性，这在净化领域中是需要避免的，而手术室净化工程对这类微粒控制的途径主要体现在以下几个方面。
1.有效的阻止室外的污染侵入室内，这是手术室净化工控制污染的最主要途径，主要涉及空气净化处理的方法、室内的压力等。
2.迅速有效地排除室内应经发生的污染，这主要涉及室内的气流组织，也是体现洁净室功能的关键。
3.控制污染源，减少污染发生量，这主要涉及发生污染的设备的设置与管理和进入洁净室的人与物的净化。前者多属于工艺问题。
手术室净化工程是有着严格的保证和要求，主要有以下几点:
（1）进入手术室必须更换洗手衣裤、鞋帽。
（2）严格控制入室人数。
（3）尽量减少手术室的开门次数与时间（更不可将门打开不关），维持"相对密闭状态"，以防外来污染的进入。
（4）手术前用酒精擦拭室内物品、医疗程仪器、设备等。
（5）术后及时、彻底清洁室内所有物品、墙壁及地面。
（6）妇女女员工不可用粉、头发喷雾剂和指甲油之类的化妆品，以减少污染来源。
（7）工作服应选用不易产生静电、不易脱落纤维的涤纶和尼龙织物。
（8）定期检测层流系统功能状态，测试手术室环境空气洁净度指标和细菌培养等。总之，使用手术室净化工程，强化无菌观念和正规化管理仍然是医疗程安全的根本保证与要求，仍然是层流净化手术室工作之根本、之重点，只有当两者紧密结合起来才是趋于完美的。
